ClickCease
+ 1-915 850 - 0900 spinedoctors@gmail.com
select Page

Epigenetické

Tím funkčnej medicíny zadnej kliniky epigenetiky. Štúdium dedičných zmien v génovej expresii (aktívne verzus neaktívne gény) nezahŕňa zmeny v sekvencii DNA, zmenu fenotypu bez zmeny genotypu, čo ovplyvňuje spôsob, akým bunky čítajú gény. Epigenetická zmena je pravidelný, prirodzený jav, ktorý môže byť ovplyvnený aj viacerými faktormi: vekom, prostredím, životným štýlom a chorobným stavom. Epigenetické modifikácie sa môžu bežne prejavovať ako to, ako sa bunky terminálne diferencujú na kožné bunky, pečeňové bunky, mozgové bunky atď. A epigenetické zmeny môžu mať škodlivejšie účinky, ktoré môžu viesť k chorobám.

Nový a prebiehajúci výskum neustále odhaľuje úlohu epigenetiky pri rôznych ľudských poruchách a smrteľných ochoreniach. Epigenetické znamienka sú v dospelosti stabilnejšie. Stále sa však považujú za dynamické a upraviteľné výberom životného štýlu a vplyvom prostredia. Ukazuje sa, že epigenetické účinky sa nevyskytujú len v maternici, ale počas celého ľudského života. Ďalším objavom je, že epigenetické zmeny možno zvrátiť. Početné príklady epigenetiky ukazujú, ako môžu rôzne voľby životného štýlu a environmentálne expozície zmeniť znaky na DNA a zohrávať úlohu pri určovaní zdravotných výsledkov.


Geneticko-epigenetická výživa a naše zdravie | El Paso, TX.

Geneticko-epigenetická výživa a naše zdravie | El Paso, TX.

Ako epigenetická a personalizovaná výživa prispieva k optimálnemu zdraviu?

Väčšina z nás vie o nezdravom jedle, ako ovplyvňuje naše telo. Oni

  • Spomaliť metabolizmus
  • Pridajte hmotnosť
  • Upchávať a tvrdnúť tepny atď.
epigenetická výživa zdravie el paso tx.

Teraz však existujú potraviny a potravinové prvky, ktoré nám môžu istým spôsobom pomôcť a pochádzajú z miesta, o ktorom by sme si možno ani nepomysleli, a to je naša DNA.

Nutriepigenomics skúma súvislosti medzi stravou a biomarkermi, ktoré môžu byť pripojené alebo odstránené z našej DNA. Toto zapína alebo vypína naše gény.

Nové štúdie ukazujú, že isté potraviny alebo doplnky dokáže upraviť prejav našich génov, čo môže ovplyvniť naše zdravie.

Nutričná genomika prináša revolúciu v oblasti klinickej výživy, ako aj v oblasti výživy v oblasti verejného zdravia:

Diéta, cvičenie a vystavenie sa životnému prostrediu sú všetky prvky, ktoré preukázali úlohu pri zapínaní a vypínaní génov prostredníctvom epigenetiky. Úprava faktorov životného štýlu môže kontrolovať potenciál na zníženie chorôb a mať pozitívny vplyv na naše zdravie.

Zdravotnícki pracovníci z celého sveta začínajú začleňovať epigenetiku do svojej praxe s cieľom poskytnúť špecializovanejšie a individualizované liečebné plány.

špecialista na liečbu bolesti chrbta

„Vrstvenie informácií, ako je strava, životný štýl, faktory životného prostredia, rodinná anamnéza, symptómy a diagnózy spolu s epigenetikou, môže pomôcť priviesť niekoho k stavu optimalizovaného zdravia,“ povedala Kristy Hall, MS, RNCP, ROHP, certifikovaná odborníčka na funkčnú výživu a zakladateľka Living Well Nutrition, ktorá využíva epigenetické testovanie, výživové poradenstvo a mnohostranný prístup na lepšie zabezpečenie svojich klientov.


Môže 15, 2018Bailey Kirkpatrick diétaChoroby a poruchyprostredieNovinky a recenzie
nutričné ​​stratégie

Registrovaní dietológovia majú možnosť vydávať geneticky podmienené stravovacie odporúčania, ktoré môžu zlepšiť ľudské zdravie.

Výživa je jedným z primárnych environmentálnych faktorov, ktoré určujú naše zdravie. Medzi chronické ochorenia patria:

  • Typ diabetu 2
  • Metabolický syndróm
  • Kardiovaskulárne ochorenia
  • Neurologické ochorenie
  • Rôzne druhy rakoviny
  • Sú iniciované alebo urýchlené živinami/potravou

Túto oblasť výskumu výživy možno označiť ako nutričnú genomiku.

Jednonukleotidové polymorfizmy (SNP) sú rozdiely v jednom páre báz v DNA. Predstavujú primárnu formu ľudskej genetickej variácie.

Dna SNP

Horná molekula DNA sa líši od spodnej molekuly DNA na jednom mieste páru báz (polymorfizmus C/A)

Nutričná genetika alebo nutrigenetika zahŕňa identifikáciu, klasifikáciu a charakterizáciu ľudskej genetickej variácie, ktorá modifikuje metabolizmus / využitie živín a potravinovú toleranciu Obr.

epigenetická výživa zdravie el paso tx.
IOM. Nutrigenomika a ďalej: Informovanie o budúcnosti. Washington, DC: The National Academies Press; 2007.

Aplikácia: Genetika a epigenetika

Živiny, napr. liečivá, sú silnými efektormi expresie a stability genómu a tieto interakcie gén-živina možno optimalizovať na prevenciu chorôb.

epigenetická výživa zdravie el paso tx.

Individualizovaná výživa

Prísľub nutričného inžinierstva pre optimálne zdravie prostredníctvom stravy stále trvá, no verejnosť má pozitívne očakávania, čoho dôkazom je aj používanie doplnkov stravy.

Vedecký výskum ukazuje, že živiny v rôznych potravinách a doplnkoch, ktoré jeme, môžu byť schopné upraviť alebo zvrátiť dedičné zmeny. Tieto dôkazy môžu byť použité pri výbere lepšieho životného štýlu.

Čučoriedky majú neuveriteľne vysoký obsah antioxidantov a predpokladá sa, že táto „superpotravina“ dokáže epigeneticky znížiť poškodenie DNA, čím chráni ľudí pred rakovinou a možno aj spomalí starnutie. Čučoriedková šťava a vitamín C sa ukázali ako potenciálne inhibítory metylácie pre gén MTHFR a gén DNMT1 u ľudí.


Kim, M., Na, H., Kasai, H., Kawai, K., Li, Y.-S., & Yang, M. (2017). Porovnanie čučoriedok (Vaccinium spp.) a vitamínu C prostredníctvom antioxidačných a epigenetických účinkov na človeka. Journal of Cancer Prevention, 22(3), 174�181.

Poznanie toho, čo jeme a čo to robí s naším telom, najmä potenciálny epigenetický vplyv, je len o krok bližšie k optimálnemu zdraviu.

Úloha epigenetiky pri obezite a metabolických ochoreniach

Úloha epigenetiky pri obezite a metabolických ochoreniach

Epigenetický abstrakt:

Zvýšená prevalencia obezity a súvisiacich komorbidít je hlavným problémom verejného zdravia. Zatiaľ čo genetické faktory nepochybne zohrávajú úlohu pri určovaní individuálnej náchylnosti k prírastku hmotnosti a obezite, identifikované genetické varianty vysvetľujú iba časť variácií. To viedlo k rastúcemu záujmu o pochopenie potenciálnej úlohy epigenetiky ako sprostredkovateľa interakcií medzi génom a prostredím, ktoré sú základom rozvoja obezity a s ňou spojených komorbidít. Počiatočné dôkazy na podporu úlohy epigenetiky pri obezite a diabetes mellitus 2. typu (T2DM) poskytli najmä štúdie na zvieratách, ktoré zaznamenali epigenetické zmeny v kľúčových metabolicky dôležitých tkanivách po kŕmení s vysokým obsahom tukov a epigenetické rozdiely medzi chudými a obéznymi zvieratami a štúdie na ľuďoch, ktoré ukázali epigenetické zmeny v obezite a kandidátskych génoch T2DM u obéznych/diabetických jedincov. Nedávno viedli pokroky v epigenetických metodológiách a znížené náklady na asociačné štúdie celého epigenómu (EWAS) k rýchlemu rozšíreniu štúdií v ľudských populáciách. Tieto štúdie tiež uvádzajú epigenetické rozdiely medzi obéznymi/T2DM dospelými a zdravými kontrolami a epigenetické zmeny v súvislosti s nutričnými intervenciami, úbytkom hmotnosti a cvičením. Pribúdajú aj dôkazy zo štúdií na ľuďoch a zvieratách, že vzťah medzi perinatálnymi nutričnými expozíciami a neskorším rizikom obezity a T2DM môže byť sprostredkovaný epigenetickými zmenami u potomstva. Cieľom tohto prehľadu je zhrnúť najnovší vývoj v tejto rýchlo sa rozvíjajúcej oblasti, s osobitným zameraním na ľudské EWAS a štúdie skúmajúce vplyv faktorov výživy a životného štýlu (pre- aj postnatálnych) na epigenóm a ich vzťah k metabolickému zdravotné výsledky. Rieši sa aj ťažkosti pri rozlišovaní následkov od kauzality v týchto štúdiách a kritická úloha zvieracích modelov pri testovaní kauzálnych vzťahov a poskytovaní prehľadu o základných mechanizmoch. Stručne povedané, oblasť epigenetiky a metabolického zdravia zaznamenala rýchly vývoj v krátkom čase. Zatiaľ čo doterajšie výsledky sú sľubné, štúdie prebiehajú a nasledujúce desaťročie sľubuje, že bude časom produktívneho výskumu komplexných interakcií medzi genómom, epigenómom a prostredím, pokiaľ ide o metabolické ochorenia.

Kľúčové slová: Epigenetika, metylácia DNA, obezita, diabetes 2. typu, vývojové programovanie

úvod

Epigenetické mechanizmyObezita je komplexné, multifaktoriálne ochorenie a lepšie pochopenie mechanizmov, ktoré sú základom interakcií medzi životným štýlom, prostredím a genetikou, je rozhodujúce pre vývoj účinných stratégií prevencie a liečby [1].

V spoločnosti, kde je veľa energeticky bohatých potravín a potreba fyzickej aktivity je nízka, existuje široká škála náchylnosti jednotlivcov na rozvoj obezity a metabolických zdravotných problémov. Odhady úlohy dedičnosti v tejto variácii sú v rozsahu 40 – 70 %, a zatiaľ čo veľké celogenómové asociačné štúdie (GWAS) identifikovali množstvo genetických lokusov spojených s rizikom obezity, iba ~ 100 najbežnejších genetických variantov tvoria niekoľko percent rozptylu obezity [2, 3]. Odhady pre celý genóm sú vyššie a predstavujú ~20 % variácií [3]; veľká časť dedičnosti však zostáva nevysvetlená.

V poslednej dobe sa pozornosť sústredila na skúmanie úlohy epigenetických zmien v etiológii obezity. Tvrdilo sa, že epigenóm môže predstavovať mechanické prepojenie medzi genetickými variantmi a environmentálnymi faktormi pri určovaní rizika obezity a mohol by pomôcť vysvetliť „chýbajúcu dedičnosť“. Prvé epigenetické štúdie na ľuďoch boli malé a skúmali len obmedzený počet lokusov. Aj keď to vo všeobecnosti viedlo k zlej reprodukovateľnosti, niektoré z týchto skorých zistení, napríklad vzťah medzi metyláciou PGC1A a diabetes mellitus 2. typu (T2DM) [4] a iné, ako sa uvádza v práci van Dijk et al. [5], boli replikované v neskorších štúdiách. Nedávne pokroky a zvýšená cenová dostupnosť vysokovýkonných technológií teraz umožňujú rozsiahle asociačné štúdie širokého epigenómu (EWAS) a integráciu rôznych vrstiev genómových informácií s cieľom preskúmať komplexné interakcie medzi genotypom, epigenómom, transkriptómom a prostredím [6� 9]. Tieto štúdie sú stále v plienkach, ale doterajšie výsledky ukázali sľubné pri vysvetľovaní rozdielov v náchylnosti k obezite.

Existuje čoraz viac dôkazov, že obezita má mentálny pôvod, pretože vystavenie sa suboptimálnemu zásobovaniu živinami pred narodením alebo v ranom detstve je spojené so zvýšeným rizikom obezity a metabolických ochorení v neskoršom veku [10�13]. Štúdie na zvieratách spočiatku ukázali, že celý rad nutričných expozícií v ranom veku, najmä tých, ktoré sa vyskytli na začiatku tehotenstva, by mohol vyvolať epigenetické zmeny v kľúčových metabolických tkanivách potomstva, ktoré pretrvávali po narodení a viesť k trvalým zmenám vo funkcii génov [13�17]. Objavujú sa dôkazy, ktoré podporujú existenciu rovnakého mechanizmu u ľudí. To viedlo k hľadaniu epigenetických znakov prítomných v ranom veku, ktoré predpovedajú neskoršie riziko metabolického ochorenia, a k štúdiám na určenie, či je možné epigenetickému programovaniu metabolického ochorenia zabrániť alebo ho v neskoršom živote zvrátiť.

Tento prehľad poskytuje aktualizáciu nášho predchádzajúceho systematického prehľadu štúdií o epigenetike a obezite u ľudí [5]. Náš predchádzajúci prehľad ukázal sľubné výsledky počiatočných štúdií vrátane prvých potenciálnych epigenetických znakov obezity, ktoré bolo možné zistiť pri narodení (napr. RXRA) [18]. Zdôraznila však aj obmedzenú reprodukovateľnosť zistení a nedostatok rozsiahlejších dlhodobých vyšetrovaní. Súčasný prehľad sa zameriava na najnovší vývoj v tejto rýchlo sa rozvíjajúcej oblasti a najmä na ľudský EWAS a štúdie skúmajúce vplyv (pre- a postnatálnych) faktorov výživy a životného štýlu na epigenóm a objavujúcu sa úlohu epigenetiky v patológii obezity. . Zaoberáme sa aj ťažkosťami pri identifikácii kauzality v týchto štúdiách a dôležitosťou zvieracích modelov pri poskytovaní prehľadu o mechanizmoch.

preskúmanie

Epigenetické zmeny u zvieracích modelov obezity

jedenie králikaZvieracie modely poskytujú jedinečné príležitosti pre vysoko kontrolované štúdie, ktoré poskytujú mechanický pohľad na úlohu špecifických epigenetických znakov, a to ako indikátorov súčasného metabolického stavu, tak aj ako prediktorov budúceho rizika obezity a metabolických ochorení. Obzvlášť dôležitým aspektom štúdií na zvieratách je, že umožňujú hodnotenie epigenetických zmien v cieľových tkanivách, vrátane pečene a hypotalamu, čo je u ľudí oveľa ťažšie. Okrem toho schopnosť zozbierať veľké množstvá čerstvého tkaniva umožňuje posúdiť viaceré chromatínové značky, ako aj metyláciu DNA. Niektoré z týchto epigenetických modifikácií buď samotné alebo v kombinácii, môžu reagovať na environmentálne programovanie. Na zvieracích modeloch je možné študovať aj viac generácií potomkov a umožniť tak odlíšenie medzi transgeneračným a medzigeneračným prenosom rizika obezity sprostredkovaným epigenetickou pamäťou nutričného stavu rodičov, ktoré sa v štúdiách na ľuďoch nedajú ľahko rozlíšiť. Prvý termín používame pre meiotický prenos rizika v neprítomnosti pokračujúcej expozície, zatiaľ čo druhý znamená predovšetkým priamy prenos rizika prostredníctvom metabolického preprogramovania plodu alebo gamét.

Štúdie na zvieratách zohrali rozhodujúcu úlohu v našom súčasnom chápaní úlohy epigenetiky vo vývojovom pôvode obezity a T2DM. Zvýšená aj znížená výživa matky počas tehotenstva bola spojená so zvýšeným ukladaním tuku u potomstva väčšiny doteraz študovaných druhov cicavcov (prehľad v [11, 13�15, 19]). Výživa matky počas tehotenstva má nielen potenciál pre priame účinky na plod, ale môže tiež priamo ovplyvniť vyvíjajúce sa oocyty ženských plodov a primordiálne zárodočné bunky plodov mužského pohlavia, a preto by mohla mať vplyv na potomkov aj vnukov. Na rozlíšenie medzi materskými medzigeneračnými a transgeneračnými prenosovými mechanizmami sú preto zvyčajne potrebné viacgeneračné údaje.

Tabuľka 1 sumarizuje rôzne zvieracie modely, ktoré sa použili na poskytnutie dôkazov o metabolických a epigenetických zmenách u potomkov spojených s rodičovskou úrovňou výživy. Obsahuje tiež informácie týkajúce sa štúdií identifikujúcich zmenené epigenetické znaky u dospelých jedincov, ktorí podstupujú priame výživové problémy. Tabuľka je štruktúrovaná podľa navrhovaného typu prenosu rizika.

tabuľka 1(i) Epigenetické zmeny u potomstva spojené s výživou matky počas tehotenstva

Výživové doplnky matky, podvýživa a nadmerná výživa počas tehotenstva môžu zmeniť ukladanie tuku a energetickú homeostázu u potomstva [11, 13�15, 19]. S týmito účinkami u potomstva sú spojené zmeny v metylácii DNA, posttranslačné modifikácie histónov a génová expresia pre niekoľko cieľových génov, najmä génov regulujúcich metabolizmus mastných kyselín a inzulínovú signalizáciu [16, 17, 20 - 30]. Rozmanitosť zvieracích modelov použitých v týchto štúdiách a ovplyvnené bežné metabolické dráhy naznačujú evolučne konzervovanú adaptívnu reakciu sprostredkovanú epigenetickou modifikáciou. Avšak niekoľko špecifických identifikovaných génov a epigenetických zmien bolo krížovo overených v súvisiacich štúdiách a rozsiahle výskumy v rámci celého genómu sa zvyčajne neuplatňovali. Hlavnou prekážkou porovnania týchto štúdií sú rôzne vývojové mentálne okná vystavené nutričným výzvam, ktoré môžu spôsobiť značne odlišné výsledky. Vyžaduje sa tiež dôkaz, že epigenetické zmeny sú skôr kauzálne než spojené s fenotypovými zmenami potomstva. To si vyžiada identifikáciu rodičovskej nutrične indukovanej epigenetickej �pamäťovej� odpovede, ktorá predchádza vývoju zmeneného fenotypu u potomstva.

(ii) Účinky otcovskej výživy na epigenetické znaky potomstva

dieťa spí, drží sa za rukyNové štúdie ukázali, že otcovská úroveň výživy môže ovplyvniť ukladanie tuku u potomkov a epigenetické znaky [31�34]. Jeden nedávny výskum na myšiach ukázal, že prediabetes u otca vedie k zvýšenej náchylnosti na diabetes u F1 potomkov so súvisiacimi zmenami v expresii génov pankreasu a metylácii DNA spojenej s inzulínovou signalizáciou [35]. Dôležité je, že došlo k prekrývaniu týchto epigenetických zmien v pankreatických ostrovčekoch a spermiách, čo naznačuje dedičnosť zárodočnej línie. Avšak väčšina z týchto štúdií, aj keď je zaujímavá vo svojich dôsledkoch, je obmedzená v genómovej škále skúmania a často vykazuje slabé a trochu prechodné epigenetické zmeny spojené s miernymi metabolickými fenotypmi u potomkov.

(iii)Potenciálne transgeneračné epigenetické zmeny podporujúce ukladanie tuku u potomstva

nadmerná výživaStabilný prenos epigenetických informácií naprieč viacerými generáciami je dobre opísaný v rastlinných systémoch a C. elegánov, ale o jeho význame u cicavcov sa stále veľa diskutuje [36, 37]. Epigenetický základ pre prenos fenotypov starými rodičmi v reakcii na expozíciu v strave je dobre známy, a to aj u druhov hospodárskych zvierat [31]. Najvplyvnejšie štúdie demonštrujúce účinky epigenetického prenosu ovplyvňujúceho fenotyp potomstva použili príklad životaschopnej žltej myši aguti (Avy) [38]. U tejto myši inzercia retrotranspozónu upstream od génu agouti spôsobuje jeho konštitutívnu expresiu a následnú žltú farbu srsti a nástup obezity u dospelých. Materský prenos cez zárodočnú líniu vedie k umlčaniu expresie agouti sprostredkovanej metyláciou DNA, čo vedie k farbe srsti divokého typu a chudému fenotypu potomstva [39, 40]. Dôležité je, že následné štúdie na týchto myšiach ukázali, že vystavenie matiek donorom metylu spôsobuje zmenu farby srsti [41]. Jedna štúdia uvádza prenos fenotypu do generácie F3 a zmeny v expresii veľkého počtu génov v reakcii na obmedzenie proteínov vo F0 [42]; avšak zmeny v expresii boli veľmi variabilné a v tomto systéme nebola identifikovaná priama súvislosť s epigenetickými zmenami.

(iv) Priame vystavenie jednotlivcov nadmernej výžive v postnatálnom živote

moderný západný životný štýlZatiaľ čo mnohé štúdie identifikovali epigenetické zmeny súvisiace so stravou na zvieracích modeloch pomocou kandidátskych miestne špecifických oblastí, vykonalo sa len málo analýz v rámci celého genómu. Nedávna štúdia sa zamerala na určenie priameho epigenetického vplyvu diét s vysokým obsahom tukov / obezity vyvolanej diétou u dospelých myší pomocou génovej expresie v celom genóme a analýz metylácie DNA [43]. Táto štúdia identifikovala 232 rozdielne metylovaných oblastí (DMR) v adipocytoch z kontrolných myší a myší s vysokým obsahom tuku. Dôležité je, že zodpovedajúce ľudské oblasti pre myšie DMR boli tiež rozdielne metylované v tukovom tkanive z populácie obéznych a štíhlych ľudí, čím sa zdôraznila pozoruhodná evolučná konzervácia týchto oblastí. Tento výsledok zdôrazňuje pravdepodobný význam identifikovaných DMR pri regulácii energetickej homeostázy u cicavcov.

Ľudské štúdie

anatomický 3D model

Na základe dôkazov zo štúdií na zvieratách a so zvyšujúcou sa dostupnosťou cenovo dostupných nástrojov na analýzu celého genómu došlo k rýchlemu rozšíreniu štúdií epigenómu u ľudí. Tieto štúdie sa väčšinou zamerali na identifikáciu miestne špecifických rozdielov v metylácii DNA, ktoré sú spojené s metabolickými fenotypmi.

Kľúčovou otázkou je, do akej miery epigenetické modifikácie prispievajú k rozvoju metabolického fenotypu, a nie sú len jeho následkom (obr. 1). Epigenetické programovanie by mohlo prispieť k rozvoju obezity, ako aj zohrávať úlohu pri následnom riziku kardiovaskulárnych a metabolických problémov. V štúdiách na ľuďoch je ťažké dokázať kauzalitu [44], ale je možné vyvodiť závery z množstva dôkazov:

fig 1i) Štúdie genetickej asociácie. Genetické polymorfizmy, ktoré sú spojené so zvýšeným rizikom vzniku konkrétnych stavov, sú a priori spojené s kauzálnymi génmi. Prítomnosť diferenciálnej metylácie v takýchto oblastiach vyvodzuje funkčnú relevanciu týchto epigenetických zmien pri kontrole expresie proximálneho génu (génov). Existujú silné cis-pôsobiace genetické účinky podporujúce veľkú epigenetickú variáciu [7, 45] a v štúdiách založených na populácii sa použili metódy, ktoré používajú genetické náhrady na odvodenie kauzálnej alebo sprostredkovateľskej úlohy rozdielov v epigenómoch [7, 46�48]. . Použitie familiárnej genetickej informácie môže tiež viesť k identifikácii potenciálne kauzálnych kandidátskych oblastí vykazujúcich fenotypovo súvisiacu diferenciálnu metyláciu [49].

(ii) Načasovanie epigenetických zmien. Prítomnosť epigenetickej značky pred vývojom fenotypu je základným znakom spojeným s kauzalitou. Naopak, prítomnosť značky v spojení s obezitou, ale nie pred jej rozvojom, môže byť použitá na vylúčenie kauzality, ale nevylučuje by možnú úlohu v následnej patológii súvisiacej s obezitou.

(iii) Pravdepodobné vyvodenie mechanizmu. To sa týka epigenetických zmien, ktoré sú spojené so zmenenou expresiou génov so zavedenou úlohou pri regulácii fenotypu záujmu. Jedným z takýchto príkladov je spojenie metylácie na dvoch miestach CpG v géne CPT1A s hladinami cirkulujúcich triglyceridov [50]. CPT1A kóduje karnitín palmitoyltransferázu 1A, enzým s ústrednou úlohou v metabolizme mastných kyselín, a to silne svedčí o tom, že rozdielna metylácia tohto génu môže byť v príčinnej súvislosti so zmenami koncentrácií triglyceridov v plazme.

Epigenome-Wide Association Studies: Identifikácia epigenetických biomarkerov metabolického zdravia

Niekoľko nedávnych výskumov sa zameralo na skúmanie súvislostí medzi obezitou/metabolickými chorobami a metyláciou DNA v genóme (tabuľka 2). Doteraz najväčší publikovaný EWAS, ktorý zahŕňal celkovo 5465 jedincov, identifikoval 37 metylačných miest v krvi, ktoré súviseli s indexom telesnej hmotnosti (BMI), vrátane miest v CPT1A, ABCG1 a SREBF1 [51]. Ďalšia rozsiahla štúdia ukázala konzistentné asociácie medzi BMI a metyláciou v HIF3A v plnej krvi a tukovom tkanive [52], čo je zistenie, ktoré sa čiastočne zopakovalo aj v iných štúdiách [9, 51]. Ďalšie nedávno hlásené súvislosti medzi opatreniami súvisiacimi s obezitou a metyláciou DNA zahŕňajú (i) rozdiely v metylácii DNA medzi chudými a obézny jedincov v LY86 v krvných leukocytoch [53]; (ii) asociácie medzi metyláciou promótora PGC1A v plnej krvi detí a adipozitou o 5 rokov neskôr [54]; (iii) súvislosti medzi pomerom pásu a bokov a metyláciou ADRB3 v krvi [55]; a (iv) asociácie medzi BMI, meraniami distribúcie telesného tuku a viacerými miestami metylácie DNA v tukovom tkanive [9, 56]. EWAS tiež ukázali asociácie medzi miestami metylácie DNA a krvnými lipidmi [55, 57�59], sérovými metabolitmi [60], inzulínovou rezistenciou [9, 61] a T2DM [48, 62, 63] (tabuľka 2).

tabuľka 2 pokrZ týchto štúdií sa zmenená metylácia PGC1A, HIF3A, ABCG1 a CPT1A a predtým opísaná RXRA [18] ukázali ako biomarkery spojené s metabolickým zdravím alebo možno prediktívne pre metabolické zdravie, ktoré sú tiež pravdepodobnými kandidátmi na úlohu pri rozvoji metabolického ochorenia. .

Interakcia medzi genotypom a epigenómom

Genotypový epigenómEpigenetická variácia je vysoko ovplyvnená základnou genetickou variáciou, pričom sa odhaduje, že genotyp vysvetľuje ~ 20 – 40 % variácie [6, 8]. Nedávno začalo množstvo štúdií integrovať metylómové a genotypové údaje na identifikáciu metylačných kvantitatívnych lokusov (meQTL) spojených s fenotypmi chorôb. Napríklad v tukovom tkanive sa v posilňovacom prvku pred ADCY3 identifikovalo prekrývanie meQTL s genetickým rizikovým lokusom BMI [8]. Iné štúdie tiež identifikovali prekrývanie medzi známou obezitou a rizikovými lokusmi T2DM a DMR spojenými s obezitou a T2DM [43, 48, 62]. Metylácia mnohých takýchto DMR bola tiež modulovaná kŕmením s vysokým obsahom tukov u myší [43] a stratou hmotnosti u ľudí [64]. Tieto výsledky identifikujú zaujímavú súvislosť medzi genetickými variáciami spojenými s náchylnosťou na ochorenie a ich asociáciou s oblasťami genómu, ktoré podliehajú epigenetickým modifikáciám v reakcii na nutričné ​​​​výzvy, čo naznačuje kauzálny vzťah. Úzke spojenie medzi genetickou a epigenetickou variáciou môže znamenať ich podstatnú úlohu pri vytváraní individuálnych variácií [65, 66]. Aj keď tieto zistenia naznačujú, že metylácia DNA môže byť mediátorom genetických účinkov, je tiež dôležité zvážiť, že genetické aj epigenetické procesy by mohli pôsobiť nezávisle na rovnakých génoch. Štúdie dvojčiat [8, 63, 67] môžu poskytnúť dôležité poznatky a naznačujú, že interindividuálne rozdiely v úrovniach metylácie DNA vznikajú prevažne z nezdieľaného prostredia a stochastických vplyvov, minimálne zo zdieľaných environmentálnych účinkov, ale tiež s významným vplyvom genetických variácia.

Vplyv prenatálneho a postnatálneho prostredia na epigenóm

model ploduPrenatálne prostredie: Dve nedávno publikované štúdie využili ľudské populácie, ktoré zaznamenali „prirodzené“ variácie v dodávke živín, na štúdium vplyvu výživy matiek pred alebo počas tehotenstva na metyláciu DNA u potomkov [68, 69]. V prvej štúdii sa použila gambijská kohorta matka-dieťa, aby preukázala, že sezónne variácie v príjme darcov metylu matkou počas tehotenstva a BMI matky pred tehotenstvom boli spojené so zmenenou metyláciou u dojčiat [69]. Druhá štúdia využila dospelých potomkov z kohorty Dutch Hunger Winter na skúmanie účinku prenatálnej expozície akútnemu obdobiu závažnej podvýživy matky na metyláciu DNA génov zapojených do rastu a metabolizmu v dospelosti [68]. Výsledky zdôraznili dôležitosť načasovania expozície v jej vplyve na epigenóm, pretože významné epigenetické účinky boli identifikované iba u jedincov vystavených hladomoru počas skorého tehotenstva. Dôležité je, že epigenetické zmeny sa vyskytli v spojení so zvýšeným BMI; v tejto štúdii však nebolo možné určiť, či tieto zmeny boli prítomné skôr v živote alebo ako dôsledok vyššieho BMI.

Iné nedávne štúdie poskytli dôkaz, že prenatálna nadmerná výživa a obézne alebo diabetické materské prostredie sú tiež spojené so zmenami metylácie DNA v génoch súvisiacich s embryonálnym vývojom, rastom a metabolickým ochorením u potomstva [70-73].

Zatiaľ čo údaje o ľuďoch sú vzácne, existujú náznaky, že otcovská obezita môže viesť k zmenenej metylácii imprintovaných génov u novorodencov [74], čo je účinok, o ktorom sa predpokladá, že je sprostredkovaný epigenetickými zmenami získanými počas spermatogenézy.

dieťa chodí v tráve a blatePostnatálne prostredie: Epigenóm sa vytvára de novo počas embryonálneho vývoja, a preto má prenatálne prostredie s najväčšou pravdepodobnosťou najvýznamnejší vplyv na epigenóm. Teraz je však jasné, že zmeny sa vyskytujú v „zrelom“ epigenóme pod vplyvom rôznych podmienok, vrátane starnutia, vystavenia toxínom a diétnych zmien. Napríklad zmeny v metylácii DNA v mnohých génoch v kostrovom svale a PGC1A v tukovom tkanive boli preukázané ako odpoveď na diétu s vysokým obsahom tukov [75, 76]. Zásahy na stratu telesného tuku boli tiež spojené so zmenami v metylácii DNA. Štúdie uvádzajú, že profily metylácie DNA tukového tkaniva [43, 64], mononukleárnych buniek periférnej krvi [77] a svalového tkaniva [78] u predtým obéznych pacientov sa po strate hmotnosti stávajú viac podobnými profilom štíhlych jedincov. Operácia na zníženie hmotnosti tiež čiastočne zvrátila metylačné zmeny v pečeni spojené s nealkoholickým stukovatením pečene [79] a v inej štúdii viedla k hypometylácii viacerých kandidátskych génov na obezitu s výraznejšími účinkami v subkutánnom v porovnaní s omentálnym (viscerálnym) tukom [64]. . Hromadné dôkazy naznačujú, že cvičebné zásahy môžu tiež ovplyvniť metyláciu DNA. Väčšina týchto štúdií bola vykonaná na štíhlych jedincoch [80–82], ale jedna cvičebná štúdia u obéznych jedincov s T2DM preukázala aj zmeny v metylácii DNA, vrátane génov zapojených do transportu mastných kyselín a glukózy [83]. Epigenetické zmeny sa vyskytujú aj so starnutím a najnovšie údaje naznačujú úlohu obezity pri ich rozširovaní [9, 84, 85]. Obezita urýchlila epigenetický vek pečeňového tkaniva, ale na rozdiel od vyššie popísaných zistení nebol tento efekt po strate hmotnosti reverzibilný [84].

Súhrnne dôkazy podporujúce schopnosť modulovať epigenóm u dospelých naznačujú, že môže existovať potenciál zasahovať do postnatálneho života s cieľom modulovať alebo zvrátiť nepriaznivé epigenetické programovanie.

Veľkosti účinku a rozdiely medzi typmi tkanív

spojovacie tkaniváZmeny metylácie DNA spojené s obezitou alebo vyvolané diétou alebo zásahmi do životného štýlu a úbytkom hmotnosti sú vo všeobecnosti mierne (< 15 %), hoci sa líšia v závislosti od študovaného fenotypu a tkaniva. Napríklad zmeny väčšie ako 20 % boli hlásené v tukovom tkanive po strate hmotnosti [64] a asociácie medzi metyláciou HIF3A a BMI v tukovom tkanive boli výraznejšie ako v krvi [52].

Biologický význam relatívne malých metylačných zmien bol spochybnený. Avšak v tkanivách pozostávajúcich zo zmesi bunkových typov môže malá zmena v metylácii DNA v skutočnosti odrážať významnú zmenu v špecifickej bunkovej frakcii. Integrácia údajov o epigenóme s transkriptómom a inými epigenetickými údajmi, ako sú modifikácie histónov, je dôležitá, pretože malé zmeny metylácie DNA môžu odrážať väčšie zmeny v štruktúre chromatínu a môžu byť spojené so širšími zmenami v génovej expresii. Mal by sa zvážiť aj genómový kontext; malé zmeny v regulačnom prvku, ako je promótor, zosilňovač alebo izolátor, môžu mať funkčný význam. V tomto ohľade sa pozorovalo, že DMR pre obezitu, ako aj oblasti ovplyvnené prenatálnym vystavením hladomoru a meQTL pre lokusy metabolických vlastností sa prekrývajú zosilňovacie prvky [8, 43, 68]. Existujú dôkazy, že metylácia DNA v oblastiach spojených s hladom by mohla skutočne ovplyvniť aktivitu zosilňovača [68], čo podporuje úlohu zmien metylácie vyvolaných výživou v génovej regulácii.

Hlavným obmedzením v mnohých štúdiách na ľuďoch je, že epigenetické znaky sa často hodnotia v periférnej krvi, a nie v metabolicky relevantných tkanivách (obr. 2). Heterogenita krvi je problémom, pretože rôzne bunkové populácie majú odlišné epigenetické podpisy, ale na prekonanie tohto problému boli vyvinuté algoritmy na odhadnutie bunkového zloženia [86]. Možno ešte dôležitejšie je, že epigenetické značky v krvných bunkách nemusia nevyhnutne hlásiť stav tkanív primárneho záujmu. Napriek tomu nedávne štúdie poskytli jasný dôkaz o vzťahu medzi epigenetickými znakmi v krvných bunkách a BMI. V prípade HIF3A, pre ktorý sa úroveň metylácie (hodnota beta) v skúmanej populácii pohybovala od 0.14 do 0.52, bolo 10 % zvýšenie metylácie spojené so zvýšením BMI o 7.8 %[52]. Podobne 10 % rozdiel v metylácii PGC1A môže predpovedať až 12 % rozdiel v hmote tuku [54].

fig 2Závery

Štúdium úlohy epigenetiky pri obezite a metabolických ochoreniach sa v posledných rokoch rýchlo rozšírilo a hromadia sa dôkazy o spojitosti medzi epigenetickými modifikáciami a výsledkami metabolického zdravia u ľudí. Z nedávnych štúdií vyplynuli aj potenciálne epigenetické biomarkery spojené s obezitou a metabolickým zdravím. Validácia epigenetických znakov vo viacerých kohortách, skutočnosť, že niekoľko znakov sa nachádza v génoch s hodnovernou funkciou pri obezite a vývoji T2DM, ako aj prekrývanie epigenetických znakov so známou obezitou a genetickými lokusmi T2DM posilňuje dôkaz, že tieto asociácie sú reálny. Kauzalitu bolo doteraz ťažké stanoviť; avšak bez ohľadu na to, či sú asociácie kauzálne, identifikované epigenetické znaky môžu byť stále relevantné ako biomarkery pre obezita a riziko metabolických ochorení.

Veľkosť účinku v ľahko dostupných tkanivách, ako je krv, je malá, ale zdá sa, že je reprodukovateľná napriek rozdielom v etnickej príslušnosti, type tkaniva a metódach analýzy [51]. Aj malé zmeny metylácie DNA môžu mať biologický význam. Integratívny omický prístup bude kľúčový pri ďalšom odhaľovaní komplexných interakcií medzi epigenómom, transkriptómom, genómom a metabolickým zdravím. Pozdĺžne štúdie, ideálne zahŕňajúce viacero generácií, sú nevyhnutné na stanovenie príčinných vzťahov. V budúcnosti môžeme očakávať viac takýchto štúdií, ale bude to chvíľu trvať.

Zatiaľ čo štúdie na zvieratách naďalej preukazujú vplyv raného veku nutričné expozície na epigenóm a metabolické zdravie potomstva, údaje o ľuďoch sú stále obmedzené. Nedávne štúdie však poskytli jasný dôkaz, že vystavenie sa suboptimálnej výžive počas špecifických období prenatálneho vývoja je spojené s metylačnými zmenami u potomstva, a preto má potenciál ovplyvniť fenotyp dospelých. Štúdie na zvieratách budú dôležité na overenie ľudských nálezov vo viac kontrolovanom prostredí, pomôžu určiť, či identifikované metylačné zmeny majú nejaký vplyv na metabolické zdravie, a odhaliť mechanizmy, ktoré sú základom tejto medzigeneračnej/transgeneračnej epigenetickej regulácie. Dôležitými otázkami, ktoré je potrebné riešiť, zostáva identifikácia kauzálnych mechanizmov, ktoré sú základom metabolických pamäťových reakcií, spôsob prenosu fenotypových účinkov do po sebe nasledujúcich generácií, stupeň vplyvu a stability prenášaného znaku a identifikácia zastrešujúceho a zjednocujúceho evolučného kontextu. . Ten je často zapuzdrený hypotézou prediktívnej adaptívnej odpovede, tj odpoveďou na budúce očakávané prostredie, ktoré zvyšuje kondíciu populácie. Táto hypotéza je však čoraz viac spochybňovaná, pretože existujú obmedzené dôkazy o zvýšenej kondícii v neskoršom veku [87].

Stručne povedané, výsledky sú sľubné, pretože epigenetické zmeny sú spojené s metabolickým zdravím dospelých a pôsobia ako mediátor medzi zmenenou prenatálnou výživou a následným zvýšeným rizikom zlých výsledkov metabolického zdravia. Boli identifikované nové epigenetické znaky, ktoré sú spojené s mierami metabolického zdravia. Integrácia rôznych vrstiev genómových informácií pridala ďalšiu podporu kauzálnym vzťahom a uskutočnili sa ďalšie štúdie ukazujúce účinky pre- a postnatálneho prostredia na epigenóm a zdravie. Zatiaľ čo zostáva veľa dôležitých otázok, nedávny metodologický pokrok umožnil typy rozsiahlych populačných štúdií, ktoré budú potrebné na riešenie nedostatkov vo vedomostiach. Nasledujúce desaťročie sľubuje, že bude obdobím veľkých aktivít v tejto dôležitej výskumnej oblasti.

Susan J. van Dijk1, Ross L. Tellam2, Janna L. Morrison3, Beverly S. Muhlhausler4,5� a Peter L. Molloy1*�

Konkurenčné záujmy

Autori vyhlasujú, že nemajú konkurenčné záujmy.

Príspevky autorov
Všetci autori prispeli k vypracovaniu a kritickej revízii rukopisu a všetci autori prečítali a schválili konečný rukopis.

Informácie o autoroch
Beverly S. Muhlhausler a Peter L. Molloy sú spoločnými poslednými autormi.

Poďakovanie

Táto práca bola podporená grantom Nadačného fondu vedy a priemyslu (Grant RP03-064). JLM a BSM sú podporované štipendiami Rady pre rozvoj kariéry National Health and Medical Research Council (JLM, APP1066916; BSM, APP1004211). Ďakujeme Lance Macaulay a Sue Mitchell za kritické čítanie a komentáre k rukopisu.

Podrobnosti o autorovi

1CSIRO Food and Nutrition Flagship, PO Box 52, North Ryde, NSW 1670, Australia. 2CSIRO Agriculture Flagship, 306 Carmody Road, St Lucia, QLD 4067, Austrália. 3 Skupina Early Origins of Adult Health Research Group, School of Pharmacy and Medical Sciences, Sansom Institute for Health Research, University of South Australia, GPO Box 2471, Adelaide, SA 5001, Australia�4FOODplus Research Centre, Waite Campus, The University of Adelaide, PMB 1, Glen Osmond, SA 5064, Austrália. 5 Inštitút pre výskum zdravia žien a detí, 72 King William Road, North Adelaide, SA 5006, Austrália.

prázdny
Referencie:

1. KTO. KTO | Nadváha a obezita. www.who.int/gho/ncd/
risk_factors/overweight/en/index.html. Prístupné 29. januára 2015.
2. Visscher PM, Brown MA, McCarthy MI, Yang J. Päť rokov objavu GWAS.
Am J Hum Genet. 2012; 90:7�24.
3. Locke AE, Kahali B, Berndt SI, Justice AE, Pers TH, Day FR, et al. Genetické
štúdie indexu telesnej hmotnosti prinášajú nové poznatky pre biológiu obezity. Príroda.
2015;518:197�206.
4. Ling C, Del Guerra S, Lupi R, R.nn T, Granhall C, Luthman H, a kol.
Epigenetická regulácia PPARGC1A v ľudských diabetických ostrovčekoch typu 2 a
vplyv na sekréciu inzulínu. Diabetológia. 2008;51:615�22.
5. Van Dijk SJ, Molloy PL, Varinli H, Morrison JL, Muhlhausler BS. Epigenetika
a ľudská obezita. Int J Obes (Londýn). 2015;39:85�97.
6. Teh AL, Pan H, Chen L, Ong ML, Dogra S, Wong J a kol. Účinok
genotypu a in utero prostredí na interindividuálnu variáciu u novorodenca
DNA metylómy. Genome Res. 2014;24:1064�74.
7. Olsson AH, Volkov P, Bacos K, Dayeh T, Hall E, Nilsson EA a kol. Genomewide
asociácie medzi vplyvom genetickej a epigenetickej variácie
Expresia mRNA a sekrécia inzulínu v ľudských pankreatických ostrovčekoch. PLoS
Genet. 2014;10:e1004735.
8. Grundberg E, Meduri E, Sandling JK, Hedman AK, Keildson S, Buil A a kol.
Globálna analýza variácií metylácie DNA v tukovom tkanive z dvojčiat
odhaľuje väzby na varianty spojené s ochorením v distálnych regulačných prvkoch.
Am J Hum Genet. 2013; 93:876�90.
9. Ronn T, Volkov P, Gillberg L, Kokosar M, Perfilyev A, Jacobsen AL, et al.
Vplyv veku, BMI a hladín HbA1c na DNA celého genómu
metylácia a vzory expresie mRNA v ľudskom tukovom tkanive
a identifikácia epigenetických biomarkerov v krvi. Hum Mol Genet.
2015;24:3792�813.
10. Waterland RA, Michels KB. Epigenetická epidemiológia vývinu
hypotéza pôvodu. Annu Rev Nutr. 2007;27:363�88.
11. McMillen IC, Rattanatray L, Duffield JA, Morrison JL, MacLaughlin SM, Gentili
S, a kol. Skoré počiatky neskoršej obezity: cesty a mechanizmy. Adv
Exp Med Biol. 2009;646:71�81.
12. Ravelli A, van der Meulen J, Michels R., Osmond C., Barker D., Hales C. a kol.
Glukózová tolerancia u dospelých po prenatálnej expozícii hladomoru. Lancet.
1998;351:173�7.
13. McMillen IC, MacLaughlin SM, Muhlhausler BS, Gentili S, Duffield JL,
Morrison JL. Vývojový pôvod zdravia a choroby dospelých: úloha
perikoncepčná a fetálna výživa. Basic Clin Pharmacol Toxicol.
2008;102:82�9.
14. Zhang S, Rattanatray L, McMillen IC, Suter CM, Morrison JL. Perikoncepčné
výživy a včasného naprogramovania života s obezitou alebo nepriazňou osudu. Prog
Biophys Mol Biol. 2011;106:307�14.
15. Bouret S, Levin BE, Ozanne SE. Riadenie interakcií medzi génmi a prostredím
energetická a glukózová homeostáza a vývojový pôvod obezity.
Physiol Rev. 2015;95:47�82.
16. Borengasser SJ, Zhong Y, Kang P, Lindsey F, Ronis MJ, Badger TM a kol.
Obezita matiek zvyšuje diferenciáciu bieleho tukového tkaniva a mení sa
metylácia DNA na úrovni genómu u potomkov samcov potkanov. Endokrinológia.
2013;154:4113�25.
17. Gluckman PD, Lillycrop KA, Vickers MH, Pleasants AB, Phillips ES, Beedle AS,
a kol. Metabolická plasticita počas vývoja cicavcov je smerovaná
v závislosti od skorého stavu výživy. Proc Natl Acad Sci USA A.
2007;104:12796�800.
18. Godfrey KM, Sheppard A, Gluckman PD, Lillycrop KA, Burdge GC, McLean C,
a kol. Metylácia promótora epigenetického génu pri narodení je spojená s
neskoršia adipozita dieťaťa. Diabetes. 2011;60:1528�34.
19. McMillen IC, Adam CL, Muhlhausler BS. Počiatky obezity:
programovanie regulačného systému chuti do jedla. J Physiol. 2005;565(Pt 1):9�17.
20. Begum G, Stevens A, Smith EB, Connor K, Challis JR, Bloomfield F a kol.
Epigenetické zmeny v dráhach regulácie energie hypotalamu plodu sú
spojené s podvýživou matiek a twinningom. FASEB J.
2012;26:1694�703.
21. Ge ZJ, Liang QX, Hou Y, Han ZM, Schatten H, Sun QY a kol. Materská obezita
a diabetes môže spôsobiť zmenu metylácie DNA v spermiách
potomstvo u myší. Reprod Biol Endocrinol. 2014;12:29.
22. Jousse C, Parry L, Lambert-Langlais S, Maurin AC, Averous J, Bruhat A a kol.
Perinatálna podvýživa ovplyvňuje metyláciu a expresiu leptínu
gén u dospelých: implikácia pre pochopenie metabolického syndrómu.
FASEB J. 2011;25:3271�8.
23. Lan X, Cretney EC, Kropp J, Khateeb K, Berg MA, Penagaricano F a kol.
Materská strava počas tehotenstva indukuje génovú expresiu a DNA
metylačné zmeny v tkanivách plodu u oviec. Predná Genet. 2013;4:49.
24. Li CC, Young PE, Maloney CA, Eaton SA, Cowley MJ, Buckland ME, et al.
Materská obezita a diabetes vyvoláva latentné metabolické defekty a
rozsiahle epigenetické zmeny u izogénnych myší. Epigenetika. 2013;8:602�11.
25. Lillycrop KA, Phillips ES, Jackson AA, Hanson MA, Burdge GC. Diétny proteín
obmedzenie gravidných potkanov vyvoláva a suplementácia kyseliny listovej zabraňuje
epigenetická modifikácia expresie pečeňových génov u potomstva. J Nutr.
2005;135:1382�6.
26. Radford EJ, Ito M, Shi H, Corish JA, Yamazawa K, Isganaitis E, et al. V maternici
účinky. In utero podvýživa narúša metylóm dospelých spermií
a medzigeneračný metabolizmus. Veda. 2014;345(80):1255903.
27. Suter M, Bocock P, Showalter L, Hu M, Shope C, McKnight R a kol.
Epigenomika: vystavenie materskej strave s vysokým obsahom tukov in utero narúša
periférna cirkadiánna génová expresia u primátov (okrem človeka). FASEB J.
2011;25:714�26.
28. Suter MA, Ma J, Vuguin PM, Hartil K, Fiallo A, Harris RA a kol. V maternici
vystavenie materskej strave s vysokým obsahom tukov mení epigenetický histónový kód v a
myšací model. Am J Obs Gynecol. 2014;210:463 e1�463 e11.
29. Tosh DN, Fu Q, Callaway CW, McKnight RA, McMillen IC, Ross MG a kol.
Epigenetika programovanej obezity: zmena IUGR potkanieho pečeňového IGF1
expresia mRNA a štruktúra histónov v rýchlom verzus oneskorenom postnatálnom období
dobiehajúci rast. Am J Physiol Gastrointest Pečeň Physiol.
2010;299:G1023�9.
30. Sandovici I, Smith NH, Nitert MD, Ackers-Johnson M, Uribe-Lewis S, Ito Y,
a kol. Materská strava a starnutie menia epigenetickú kontrolu promótora
interakcie na géne Hnf4a v pankreatických ostrovčekoch potkanov. Proc Natl
Acad Sci USA A. 2011;108:5449�54.
31. Braunschweig M, Jagannathan V, Gutzwiller A, Bee G. Vyšetrovania na
transgeneračnú epigenetickú odpoveď po samčej línii u ošípaných F2. PLoS
Jeden. 2012;7, e30583.
32. Carone BR, Fauquier L, Habib N, Shea JM, Hart CE, Li R a kol. Otcovsky
indukované transgeneračné environmentálne preprogramovanie metabolických
génová expresia u cicavcov. Bunka. 2010;143:1084�96.
33. Ost A, Lempradl A, Casas E, Weigert M, Tiko T, Deniz M, et al. Diéta otcov
definuje chromatínový stav potomstva a medzigeneračnú obezitu. Bunka.
2014;159:1352�64.
34. Mart�nez D, Pentinat T, Rib� S, Daviaud C, Bloks VW, Cebri� J, et al. V maternici
podvýživa u samcov myší programuje metabolizmus pečeňových lipidov v druhej generácii
potomstvo zahŕňajúce zmenenú metyláciu DNA Lxra. Cell Metab.
2014;19:941�51.
35. Wei Y, Yang CR, Wei YP, Zhao ZA, Hou Y, Schatten H a kol. Otcovsky
indukovanej transgeneračnej dedičnosti náchylnosti na diabetes v
cicavcov. Proc Natl Acad Sci US A. 2014;111:1873�8.
36. Grossniklaus U, Kelly WG, Kelly B, Ferguson-Smith AC, Pembrey M, Lindquist
S. Transgeneračná epigenetická dedičnosť: aká dôležitá je? Nat Rev
Genet. 2013;14:228�35.
37. Pembrey M, Saffery R, ​​Bygren LO. Ľudské transgeneračné reakcie na
skúsenosti z raného veku: potenciálny vplyv na rozvoj, zdravie a
biomedicínsky výskum. J Med Genet. 2014;51:563�72.
38. Wolff GL, Kodell RL, Moore SR, Cooney CA. Materská epigenetika a metyl
doplnky ovplyvňujú expresiu génu agouti u myší Avy/a. FASEB J.
1998;12:949�57.
39. Jirtle RL, Skinner MK. Environmentálna epigenomika a náchylnosť k chorobám.
Nat Rev Genet. 2007;8:253�62.
40. Morgan HD, Sutherland HG, Martin DI, Whitelaw E. Epigenetická dedičnosť v
lokus agouti v myši. Nat Genet. 1999;23:314�8.
41. Cropley JE, Suter CM, Beckman KB, Martin DI. Epigenetická zárodočná línia
modifikácia myšacej alely A vy výživovým doplnkom. Proc
Natl Acad Sci USA 2006;103:17308�12.
42. Hoile SP, Lillycrop KA, Thomas NA, Hanson MA, Burdge GC. Diétny proteín
obmedzenie počas F0 gravidity u potkanov vyvoláva transgeneračné zmeny v
pečeňový transkriptóm u samičieho potomstva. PLoS One. 2011;6, e21668.
43. Multhaup ML, Seldin MM, Jaffe AE, Lei X, Kirchner H, Mondal P a kol. Myší človek
experimentálna epigenetická analýza odhaľuje diétne ciele a
genetická zodpovednosť za diabetické fenotypy. Cell Metab. 2015;21:138�49.
44. Michels KB, Binder AM, Dedeurwaerder S, Epstein CB, Greally JM, Gut I a kol.
Odporúčania pre návrh a analýzu celého epigenómu
asociačné štúdie. Metódy Nat. 2013;10:949�55.
45. Dayeh TA, Olsson AH, Volkov P, Almgren P, R�nn T, Ling C. Identifikácia
CpG-SNP spojené s diabetom typu 2 a diferenciálnou metyláciou DNA
v ľudských pankreatických ostrovčekoch. Diabetológia. 2013;56:1036�46.
46. ​​Relton CL, Davey Smith G. Dvojstupňová epigenetická Mendelova randomizácia: a
stratégia na stanovenie kauzálnej úlohy epigenetických procesov v dráhach
k chorobe. Int J Epidemiol. 2012;41:161�76.
47. Liu Y, Aryee MJ, Padyukov L, Fallin MD, Hesselberg E, Runarsson A, et al.
Údaje o asociácii celého epigenómu implikujú metyláciu DNA ako an
sprostredkovateľ genetického rizika pri reumatoidnej artritíde. Nat Biotechnol.
2013;31:142�7.
48. Yuan W, Xia Y, Bell CG, Yet I, Ferreira T, Ward KJ a kol. Integrovaný
epigenomická analýza lokusov náchylnosti na diabetes typu 2 u monozygotov
dvojčatá. Nat Commun. 2014;5:5719.
49. Nitert MD, Dayeh T, Volkov P, Elgzyri T, Hall E, Nilsson E, et al. Vplyv an
cvičebný zásah na metyláciu DNA v kostrovom svale od prvého stupňa
príbuzní pacientov s cukrovkou 2. typu. Diabetes. 2012;61:3322�32.
50. Gagnon F, A�ssi D, Carri� A, Morange PE, Tr�gou�t DA. Robustné overenie
asociácia hladín metylácie na lokuse CPT1A s hladinami lipidov v plazme.
J Lipid Res. 2014;55:1189�91.
51. Demerath EW, Guan W, Grove ML, Aslibekyan S, Mendelson M, Zhou YH,
a kol. Epigenómová asociačná štúdia (EWAS) BMI, zmena BMI a
obvod pása u dospelých Afroameričanov identifikuje viacnásobné replikácie
loci. Hum Mol Genet. 2015: ddv161�.
52. Dick KJ, Nelson CP, Tsaprouni L, Sandling JK, A�ssi D, Wahl S, a kol. DNA
metylácia a index telesnej hmotnosti: analýza celého genómu. Lancet.
2014;6736:1�9.
53. Su S, Zhu H, Xu X, Wang X, Dong Y, Kapuku G a kol. metylácia DNA
gén LY86 je spojený s obezitou, inzulínovou rezistenciou a
zápal. Twin Res Hum Genet. 2014;17:183�91.
54. Clarke-Harris R, Wilkin TJ, Hosking J, Pinkney J, Jeffery AN, Metcalf BS, a kol.
PGC1? metylácia promótora v krvi vo veku 5 až 7 rokov predpovedá adipozitu z
9 až 14 rokov (EarlyBird 50). Diabetes. 2014;63:2528�37.
55. Guay SP, Brisson D, Lamarche B, Biron S, Lescelleur O, Biertho L a kol.
Metylácia DNA promótora génu ADRB3 v krvi a viscerálnom tukovom tkanive
tkaniva je spojená s metabolickými poruchami u mužov. Epigenomika.
2014;6:33�43.
56. Agha G, Houseman EA, Kelsey KT, Eaton CB, Buka SL, Loucks EB. Adipozita je
spojené s profilom metylácie DNA v tukovom tkanive. Int J Epidemiol.
2014: 1.
57. Irvin MR, Zhi D, Joehanes R, Mendelson M, Aslibekyan S, Claas SA, a kol.
Epigenómová asociačná štúdia krvných lipidov nalačno v genetike o
Štúdia siete liekov na zníženie lipidov a diéty. Obeh. 2014;130:565�72.
58. Frazier-Wood AC, Aslibekyan S, Absher DM, Hopkins PN, Sha J, Tsai MY a kol.
Metylácia na lokuse CPT1A je spojená s lipoproteínovou subfrakciou
profilov. J Lipid Res. 2014;55:1324�30.
59. Pfeifferm L, Wahl S, Pilling LC, Reischl E, Sandling JK, Kunze S, a kol. DNA
metylácia génov súvisiacich s lipidmi ovplyvňuje hladiny lipidov v krvi. Circ Cardiovasc
Genet. 2015.
60. Petersen AK, Zeilinger S, Kastenm�ller G, R�misch-Margl W, Brugger M, Peters
A, a kol. Epigenetika sa stretáva s metabolomikou: asociácia týkajúca sa celého epigenómu
štúdia s metabolickými znakmi krvného séra. Hum Mol Genet. 2014;23:534�45.
61. Hidalgo B, Irvin MR, Sha J, Zhi D, Aslibekyan S, Absher D a kol. Epigenomewide
asociačná štúdia meraní glukózy, inzulínu a HOMA-IR nalačno
v genetike liekov na zníženie lipidov a štúdiu diétnej siete. Diabetes.
2014;63:801�7.
62. Dayeh T, Volkov P, Sal� S, Hall E, Nilsson E, Olsson AH a kol. V celom genóme
Analýza metylácie DNA ľudských pankreatických ostrovčekov od diabetika 2
a nediabetických darcov identifikuje kandidátske gény, ktoré ovplyvňujú inzulín
sekrétu. PLoS Genet. 2014;10, e1004160.
63. Nilsson E, Jansson PA, Perfilyev A, Volkov P, Pedersen M, Svensson MK a kol.
Zmenená metylácia DNA a ovplyvnenie diferenciálnej expresie génov
metabolizmus a zápal v tukovom tkanive od jedincov s typom 2
cukrovka. Diabetes. 2014;63:2962�76.
64. Benton MC, Johnstone A, Eccles D, Harmon B, Hayes MT, Lea RA a kol. Analýza metylácie DNA v ľudskom tukovom tkanive odhaľuje rozdielnu modifikáciu génov obezity pred a po bypasse žalúdka a hmotnosti
stratu. Gene. 2015;16:1�21.
65. Bateson P, Gluckman P. Plasticita a robustnosť vo vývoji a
evolúcia. Int J Epidemiol. 2012;41:219�23.
66. Feinberg AP, Irizarry RA, Feinberg AP, Irizarry RA. Evolúcia v zdraví a
medicína Sacklerovo kolokvium: stochastická epigenetická variácia ako hnací motor
vývojová sila, evolučná adaptácia a choroba. Proc Natl Acad
Sci US A. 2010;107(Suppl):1757�64.
67. Martino D, Loke YJ, Gordon L, Ollikainen M, Cruickshank MN, Saffery R a kol.
Pozdĺžna analýza metylácie DNA na úrovni genómu u dvojčiat od narodenia
do 18 mesiacov veku odhaľuje rýchle epigenetické zmeny v ranom veku a párovo špecifické
účinky nesúladu. Genome Biol. 2013;14:R42.
68. Tobi EW, Goeman JJ, Monajemi R, Gu H, Putter H, Zhang Y a kol. DNA
metylačné znaky spájajú prenatálnu expozíciu hladomoru s rastom a
metabolizmus. Nat Commun. 2014;5:5592.
69. Dominguez-Salas P, Moore SE, Baker MS, Bergen AW, Cox SE, Dyer RA a kol.
Výživa matky pri počatí moduluje metyláciu DNA človeka
metastabilné epialely. Nat Commun. 2014;5:3746.
70. Quilter CR, Cooper WN, Cliffe KM, Skinner BM, Prentice PM, Nelson L a kol.
Vplyv na vzorce metylácie potomkov gestačného diabetu matky
mellitus a vnútromaternicové obmedzenie rastu naznačujú spoločné gény a
cesty spojené s následným rizikom cukrovky 2. typu. FASEB J. 2014: 1�12.
71. Morales E, ženích A, Lawlor DA, Relton CL. Podpisy metylácie DNA v
pupočníková krv spojená s gestačným prírastkom hmotnosti matky: výsledky z
kohorta ALSPAC. BMC Res Notes. 2014;7:278.
72. Ruchat SM, Houde AA, Voisin G, St-Pierre J, Perron P, Baillargeon JP a kol.
Gestačný diabetes mellitus epigeneticky ovplyvňuje predovšetkým gény
podieľa sa na metabolických ochoreniach. Epigenetika. 2013;8:935�43.
73. Liu X, Chen Q, Tsai HJ, Wang G, Hong X, Zhou Y a kol. Materská
prekoncepčný index telesnej hmotnosti a DNA pupočníkovej krvi potomstva
metylácia: skúmanie raného pôvodu chorôb. Environ Mol
Mutagén. 2014;55:223�30.
74. Soubry A, Murphy SK, Wang F, Huang Z, Vidal AC, Fuemmeler BF a kol.
Novorodenci obéznych rodičov majú zmenené vzorce metylácie DNA pri
vtlačené gény. Int J Obes (Londýn). 2015;39:650�7.
75. Jacobsen SC, Br�ns C, Bork-Jensen J, Ribel-Madsen R, Yang B, Lara E, a kol.
Účinky krátkodobého prekrmovania vysokým obsahom tuku na DNA v celom genóme
metylácia v kostrovom svale zdravých mladých mužov. Diabetológia.
2012;55:3341�9.
76. Gillberg L, Jacobsen SC, R�nn T, Br�ns C, Vaag A. PPARGC1A DNA
metylácia v podkožnom tukovom tkanive u jedincov s nízkou pôrodnou hmotnosťou�
vplyv 5 dní prekrmovania vysokým obsahom tuku. Metabolizmus. 2014;63:263�71.
77. Huang YT, Maccani JZJ, Hawley NL, Wing RR, Kelsey KT, McCaffery JM.
Epigenetické vzorce u úspešných udržiavateľov chudnutia: pilotná štúdia. Int J
Obes (Londýn). 2015;39:865�8.
78. Barres R, Kirchner H, Rasmussen M, Yan J, Kantor FR, Krook A, N�slund E,
Zierath JR. Strata hmotnosti po operácii žalúdočného bypassu pri ľudskej obezite
remodeluje metyláciu promótora. Cell Rep. 2013: 1�8.
79. Ahrens M, Ammerpohl O, von Schönfels W, Kolarova J, Bens S, Itzel T, et al.
Analýza metylácie DNA pri nealkoholickom stukovatení pečene naznačuje
zreteľné znaky špecifické pre ochorenie a prestavbu po bariatrickej chirurgii.
Cell Metab. 2013;18:296�302.
80. Voisin S, Eynon N, Yan X, Bishop DJ. Cvičenie a metylácia DNA
u ľudí. Acta Physiol (Oxf). 2014;213:39�59.
81. Lindholm ME, Marabita F, Gomez-Cabrero D, Rundqvist H, Ekstr�m TJ,
Tegn�r J, a kol. Integratívna analýza odhaľuje koordinované preprogramovanie
epigenómu a transkriptómu v ľudskom kostrovom svale po
školenia. Epigenetika. 2014;9:1557�69.
82. Denham J, O�Brien BJ, Marques FZ, Charchar FJ. Zmeny v leukocytoch
metylóm a jeho vplyv na kardiovaskulárne gény po cvičení.
J Appl Physiol. 2014:jap.00878.2014.
83. Rowlands DS, Page RA, Sukala WR, Giri M, Ghimbovschi SD, Hayat I a kol.
Multi-omické integrované siete spájajú metyláciu DNA a miRNA
plasticity kostrového svalstva až po chronické cvičenie pri diabetickej obezite 2. typu.
Physiol Genomics. 2014;46:747�65.
84. Horvath S, Erhart W, Brosch M, Ammerpohl O, von Schonfels W, Ahrens M,
a kol. Obezita urýchľuje epigenetické starnutie ľudskej pečene. Proc Natl Acad
Sci. 2014;111:15538�43.
85. Alm�n MS, Nilsson EK, Jacobsson JA, Kalnina I, Klovins J, Fredriksson R, et al.
Analýza v celom genóme odhaľuje markery metylácie DNA, ktoré sa líšia
vek aj obezita. Gene. 2014.;548:61�7
86. Houseman EA, Molitor J, Marsit CJ. Bezreferenčné úpravy zmesi buniek
pri analýze údajov o metylácii DNA. Bioinformatika. 2014;30:1431�9.
87. Wells JC. Kritické posúdenie hypotézy prediktívnej adaptívnej odpovede.
Int J Epidemiol. 2012;41:229�35.
88. Williams-Wyss O, Zhang S, MacLaughlin SM, Kleemann D, Walker SK, Suter
CM, a kol. Počet embryí a perikoncepčná podvýživa v
ovce majú rozdielne účinky na adrenálny epigenotyp, rast a
rozvoj. Am J Physiol Endocrinol Metab. 2014;307:E141�50.
89. Zhang S, Rattanatray L, Morrison JL, Nicholas LM, Lie S, McMillen IC.
Obezita matiek a raný pôvod detskej obezity: váženie
výhody a náklady na chudnutie matky v perikoncepcii
obdobie pre potomkov. Exp Diabetes Res. 2011;2011:585749.
90. Zhang S, Williams-Wyss O, MacLaughlin SM, Walker SK, Kleemann DO, Suter
CM, a kol. Podvýživa matky počas prvého týždňa po počatí
vedie k zníženej expresii mRNA glukokortikoidného receptora v
absencia hypermetylácie GR exónu 17 v hypofýze plodu v neskor
tehotenstva. J Dev Orig Heal Dis. 2013;4:391�401.
91. Lie S, Morrison JL, Williams-Wyss O, Suter CM, Humphreys DT, Ozanne SE,
a kol. Perikoncepčné programy podvýživy zmeny v inzulínovej signalizácii
molekuly a mikroRNA v kostrovom svale u plodu s jedným plodom a dvojčaťom
ovce. Biol Reprod. 2014;90:5.
92. Van Straten EM, van Meer H, Huijkman NC, van Dijk TH, Baller JF, Verkade
HJ a kol. Aktivácia X receptora fetálnej pečene akútne indukuje lipogenézu, ale
neovplyvňuje odpoveď plazmatických lipidov na diétu s vysokým obsahom tukov u dospelých myší. Am J
Physiol Endocrinol Metab. 2009;297:E1171�8.
93. Fernandez-Twinn DS, Alfaradhi MZ, Martin-Gronert MS, Duque-Guimaraes
DE, Piekarz A, Ferland-McCollough D, a kol. Zníženie regulácie IRS-1 in
tukové tkanivo potomkov obéznych myší je naprogramované bunkovoautonómne
prostredníctvom posttranskripčných mechanizmov. Mol Metab.
2014;3:325�33.
94. Waterland RA, Travisano M, Tahiliani KG. Diétou vyvolaná hypermetylácia at
aguti životaschopná žltá sa nededí transgeneračne cez samicu.
FASEB J. 2007;21:3380�5.
95. Ge ZJ, Luo SM, Lin F, Liang QX, Huang L, Wei YC a kol. Metylácia DNA v
oocyty a pečeň samíc myší a ich potomkov: účinky vysokotukovej diéty
obezita. Env Heal Perspect. 2014;122:159�64.
96. Ollikainen M, Ismail K, Gervin K, Kyll�nen A, Hakkarainen A, Lundbom J, et al.
Zmeny metylácie DNA krvi v celom genóme na regulačných prvkoch
a heterochromatické oblasti u monozygotných dvojčiat nesúladné pre obezitu
a pečeňový tuk. Clin Epigenetics. 2015;7:1�13.

Zatvorte akordeón